¿Se puede estar afiliado a seguridad social por dos empresas?

Sí. Cada empresa deberá pagar la seguridad social del trabajador, aunque este sólo estará afiliado a una EPS y a un fondo de pensiones, y las dos empresas consignarán allí lo que corresponda a cada una según el salario del trabajador.

En el caso de la ARL cada empresa puede estar afiliada a una distinta y en ese caso sí habría una doble afiliación puesto que es la empresa la que se afilia y no el trabajador como sucede con la EPS y el fondo de pensiones.